Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms