Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms