Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF496Q96IT1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZNF496Q96IT1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF496Q96IT1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF496Q96IT1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF496Q96IT1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms