Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms