Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF4BQ92750 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms