Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms