Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ4

ABCA10, ATP-binding cassette sub-family A member 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA10Q8WWZ4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCA10Q8WWZ4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCA10Q8WWZ4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCA10Q8WWZ4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCA10Q8WWZ4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCA10Q8WWZ4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCA10Q8WWZ4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCA10Q8WWZ4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCA10Q8WWZ4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCA10Q8WWZ4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCA10Q8WWZ4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCA10Q8WWZ4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ABCA10Q8WWZ4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ABCA10Q8WWZ4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ABCA10Q8WWZ4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCA10Q8WWZ4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms