Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA2Q8TDQ7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA2Q8TDQ7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA2Q8TDQ7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA2Q8TDQ7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA2Q8TDQ7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA2Q8TDQ7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA2Q8TDQ7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms