Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ1

CD300LF, CMRF35-like molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300LFQ8TDQ1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD300LFQ8TDQ1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD300LFQ8TDQ1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms