Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL22A1Q8NFW1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms