Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms