Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms