Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms