Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATG9AQ7Z3C6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG9AQ7Z3C6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms