Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms