Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms