Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM88Q6PEY1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms