Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms