Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP4Q6FHJ7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP4Q6FHJ7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms