Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
L1TD1Q5T7N2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1TD1Q5T7N2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms