Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CC2D1BQ5T0F9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CC2D1BQ5T0F9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms