Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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