Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms