Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms