Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACSM3Q53FZ2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms