Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MICAQ29983 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MICAQ29983 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MICAQ29983 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MICAQ29983 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MICAQ29983 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MICAQ29983 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MICAQ29983 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICAQ29983 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICAQ29983 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICAQ29983 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MICAQ29983 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICAQ29983 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICAQ29983 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICAQ29983 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICAQ29983 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICAQ29983 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICAQ29983 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICAQ29983 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICAQ29983 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICAQ29983 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICAQ29983 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICAQ29983 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MICAQ29983 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICAQ29983 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms