Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME3Q16798 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME3Q16798 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME3Q16798 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME3Q16798 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME3Q16798 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME3Q16798 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME3Q16798 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ME3Q16798 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME3Q16798 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ME3Q16798 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME3Q16798 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ME3Q16798 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ME3Q16798 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ME3Q16798 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ME3Q16798 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME3Q16798 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME3Q16798 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME3Q16798 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME3Q16798 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME3Q16798 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME3Q16798 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ME3Q16798 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME3Q16798 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME3Q16798 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME3Q16798 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME3Q16798 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME3Q16798 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
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