Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms