Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VAMP3Q15836 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VAMP3Q15836 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VAMP3Q15836 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VAMP3Q15836 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VAMP3Q15836 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VAMP3Q15836 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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