Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TWIST1Q15672 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TWIST1Q15672 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TWIST1Q15672 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
TWIST1Q15672 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TWIST1Q15672 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TWIST1Q15672 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TWIST1Q15672 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TWIST1Q15672 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TWIST1Q15672 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TWIST1Q15672 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TWIST1Q15672 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TWIST1Q15672 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TWIST1Q15672 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TWIST1Q15672 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms