Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP1Q15431 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms