Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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