Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERV3-1Q14264 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERV3-1Q14264 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERV3-1Q14264 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERV3-1Q14264 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERV3-1Q14264 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERV3-1Q14264 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms