Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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