Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTCH1Q13635 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms