Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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