Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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