Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms