Protein–RNA interactions for Protein: Q12199

TIP41, Type 2A phosphatase activator TIP41, yeastyeast

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIP41Q12199 YBT1YLL048C 4986 nt2.39□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 KRE33YNL132W 3171 nt2.39□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 PUT3YKL015W 2940 nt2.39□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 SWT1YOR166C 1377 nt2.38□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 NDD1YOR372C 1665 nt2.38□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 BRE1YDL074C 2103 nt2.38□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 HMRA2YCR096C 360 nt2.38□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 snR8snR8 190 nt2.38□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 YFL032WYFL032W 321 nt2.38□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 YFR056CYFR056C 369 nt2.38□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 OST1YJL002C 1431 nt2.38□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 TIM8YJR135W-A 264 nt2.38□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 YKL111CYKL111C 336 nt2.38□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 SHE2YKL130C 741 nt2.38□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 BNI1YNL271C 5862 nt2.38□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 IRC8YJL051W 2469 nt2.37□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 BRP1YGL007W 378 nt2.37□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 HOP2YGL033W 657 nt2.37□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.37□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 URM1YIL008W 300 nt2.37□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 YJL202CYJL202C 348 nt2.37□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 SWR1YDR334W 4545 nt2.37□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.36□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 CAJ1YER048C 1176 nt2.36□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.36□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 NCE101YJL205C 162 nt2.36□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 MCM22YJR135C 720 nt2.36□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 BIL1YOR304C-A 231 nt2.36□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 EGD1YPL037C 474 nt2.36□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 STE5YDR103W 2754 nt2.36□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 KOG1YHR186C 4674 nt2.35□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 TOF1YNL273W 3717 nt2.35□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 TFB1YDR311W 1929 nt2.35□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 YEL057CYEL057C 702 nt2.35□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.35□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 MSL1YIR009W 336 nt2.35□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 RPL39YJL189W 156 nt2.35□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 VMA9YCL005W-A 222 nt2.35□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 YSW1YBR148W 1830 nt2.35□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 TPS2YDR074W 2691 nt2.35□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 YBL073WYBL073W 312 nt2.34□□□□□ -2.03
TIP41Q12199 BIT61YJL058C 1632 nt2.34□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 YNL034WYNL034W 1839 nt2.33□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 AMS1YGL156W 3252 nt2.33□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 COX1Q0045 1605 nt2.33□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.33□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 TMA22YJR014W 597 nt2.33□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 RPL25YOL127W 429 nt2.33□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 YMR31YFR049W 372 nt2.32□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 YIL058WYIL058W 285 nt2.32□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 DGR1YNL130C-A 147 nt2.32□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 PGA1YNL158W 597 nt2.32□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 ATP15YPL271W 189 nt2.32□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 snR36snR36 182 nt2.32□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 YJL181WYJL181W 1836 nt2.32□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 HRD3YLR207W 2502 nt2.32□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 CDC24YAL041W 2565 nt2.32□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 YBP1YBR216C 2025 nt2.32□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.31□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 YLR031WYLR031W 561 nt2.31□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 RPL9BYNL067W 576 nt2.31□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 FPR1YNL135C 345 nt2.31□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.31□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 SIP3YNL257C 3690 nt2.31□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 NPR3YHL023C 3441 nt2.3□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 NUP82YJL061W 2142 nt2.3□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 YDL041WYDL041W 354 nt2.3□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 MRP10YDL045W-A 288 nt2.3□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 YFL063WYFL063W 456 nt2.3□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 EMP24YGL200C 612 nt2.3□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 UTP30YKR060W 825 nt2.3□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 VPS52YDR484W 1926 nt2.3□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 TRM2YKR056W 1920 nt2.3□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 GYP5YPL249C 2685 nt2.3□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 POM152YMR129W 4014 nt2.29□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 WIP1YDR374W-A 270 nt2.29□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 YMR320WYMR320W 306 nt2.29□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 ESF2YNR054C 951 nt2.29□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 IRC23YOR044W 474 nt2.29□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 FKS1YLR342W 5631 nt2.28□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 MCD1YDL003W 1701 nt2.28□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 YJL016WYJL016W 1686 nt2.28□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 TIM11YDR322C-A 291 nt2.28□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.28□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 HYR1YIR037W 492 nt2.28□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 ISF1YMR081C 1017 nt2.28□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 COX7YMR256C 183 nt2.28□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 YOR225WYOR225W 330 nt2.28□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 SSQ1YLR369W 1974 nt2.28□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 SSY1YDR160W 2559 nt2.28□□□□□ -2.04
TIP41Q12199 TOR2YKL203C 7425 nt2.27□□□□□ -2.05
TIP41Q12199 BRO1YPL084W 2535 nt2.27□□□□□ -2.05
TIP41Q12199 YDL011CYDL011C 324 nt2.27□□□□□ -2.05
TIP41Q12199 YRB1YDR002W 606 nt2.27□□□□□ -2.05
TIP41Q12199 RPS17BYDR447C 411 nt2.27□□□□□ -2.05
TIP41Q12199 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.27□□□□□ -2.05
TIP41Q12199 RPL40AYIL148W 387 nt2.27□□□□□ -2.05
TIP41Q12199 RPL26AYLR344W 384 nt2.27□□□□□ -2.05
TIP41Q12199 YLR458WYLR458W 381 nt2.27□□□□□ -2.05
TIP41Q12199 CRS5YOR031W 210 nt2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 75.3 ms