Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms