Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGALS3BPQ08380 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms