Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms