Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 DYN2YDR424C 279 nt3.06□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 YEL043WYEL043W 2871 nt3.06□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 KAP123YER110C 3342 nt3.06□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 YAR053WYAR053W 297 nt3.06□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 RPS1AYLR441C 768 nt3.06□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 MRPL33YMR286W 261 nt3.06□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 YBR277CYBR277C 402 nt3.06□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 MMS22YLR320W 4365 nt3.06□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 HSC82YMR186W 2118 nt3.05□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 ESC1YMR219W 4977 nt3.05□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 RPL27BYDR471W 411 nt3.05□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt3.05□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 PDR11YIL013C 4236 nt3.04□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 TAE2YPL009C 3117 nt3.04□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 SCP160YJL080C 3669 nt3.04□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 ISW1YBR245C 3390 nt3.04□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 GIS1YDR096W 2685 nt3.04□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 YGL239CYGL239C 315 nt3.04□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 SNC2YOR327C 348 nt3.04□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 PCF11YDR228C 1881 nt3.04□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 TOP2YNL088W 4287 nt3.04□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 ESL1YIL151C 3357 nt3.04□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 SMC6YLR383W 3345 nt3.04□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt3.03□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 PSY1YKL076C 384 nt3.03□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 YKL118WYKL118W 312 nt3.03□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 YOR199WYOR199W 330 nt3.03□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 YPL225WYPL225W 441 nt3.03□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 VPS35YJL154C 2835 nt3.03□□□□□ -1.92
NSE3Q05541 RRP6YOR001W 2202 nt3.03□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 BFA1YJR053W 1725 nt3.02□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 PHO91YNR013C 2685 nt3.02□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 SMD1YGR074W 441 nt3.02□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 ABM1YJR108W 372 nt3.02□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 MRPL31YKL138C 396 nt3.02□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 RPS29AYLR388W 171 nt3.02□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 YOR055WYOR055W 435 nt3.02□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 CBF2YGR140W 2871 nt3.02□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 TMN3YER113C 2121 nt3.01□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 QCR7YDR529C 384 nt3.01□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 NOP10YHR072W-A 177 nt3.01□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt3.01□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 SMY2YBR172C 2223 nt3.01□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 YNL018CYNL018C 1839 nt3□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 PFF1YBR074W 2931 nt3□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 CDC50YCR094W 1176 nt3□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt3□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 IRC23YOR044W 474 nt3□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt3□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 NUP170YBL079W 4509 nt3□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 FAR11YNL127W 2862 nt3□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 ISF1YMR081C 1017 nt2.99□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 PGA1YNL158W 597 nt2.99□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 AFI1YOR129C 2682 nt2.99□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 SRO77YBL106C 3033 nt2.99□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 APL5YPL195W 2799 nt2.99□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 AIM9YER080W 1884 nt2.99□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 ARP8YOR141C 2646 nt2.98□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 MSB1YOR188W 3414 nt2.98□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 DAD4YDR320C-A 219 nt2.98□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 WIP1YDR374W-A 270 nt2.98□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.98□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 RPL26AYLR344W 384 nt2.98□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 YBL073WYBL073W 312 nt2.98□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 SWA2YDR320C 2007 nt2.98□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 DOT6YER088C 2013 nt2.98□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 RIC1YLR039C 3171 nt2.97□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 RPS24AYER074W 408 nt2.97□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 TIM13YGR181W 318 nt2.97□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.97□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 DIS3YOL021C 3006 nt2.97□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 CRM1YGR218W 3255 nt2.97□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 MRD1YPR112C 2664 nt2.96□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 TRS130YMR218C 3309 nt2.96□□□□□ -1.93
NSE3Q05541 YIL080WYIL080W 4722 nt2.96□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 SLH1YGR271W 5904 nt2.96□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 MMS1YPR164W 4224 nt2.96□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 VTC1YER072W 390 nt2.96□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 TWF1YGR080W 999 nt2.96□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 YKL083WYKL083W 615 nt2.96□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 HSK3YKL138C-A 210 nt2.96□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 YAF9YNL107W 681 nt2.96□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 YPL229WYPL229W 621 nt2.96□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 STE11YLR362W 2154 nt2.95□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 KEL2YGR238C 2649 nt2.95□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 YKU80YMR106C 1890 nt2.95□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 YHL037CYHL037C 402 nt2.95□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 MAM33YIL070C 801 nt2.95□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 RPS27AYKL156W 249 nt2.95□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 YPR099CYPR099C 357 nt2.95□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 KRE33YNL132W 3171 nt2.94□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.94□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 SNC1YAL030W 354 nt2.94□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 PRP8YHR165C 7242 nt2.93□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 ORC2YBR060C 1863 nt2.93□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.93□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 TIM18YOR297C 579 nt2.93□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 VMA9YCL005W-A 222 nt2.93□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 SCD5YOR329C 2619 nt2.92□□□□□ -1.94
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