Protein–RNA interactions for Protein: Q04002

SCC2, Sister chromatid cohesion protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SCC2Q04002 RTR1YER139C 681 nt0.1□□□□□ -2.39
SCC2Q04002 YNL226WYNL226W 411 nt0.1□□□□□ -2.39
SCC2Q04002 ADF1YCL058W-A 342 nt0.1□□□□□ -2.39
SCC2Q04002 ENV11YGR071C 2583 nt0.1□□□□□ -2.39
SCC2Q04002 YDL206WYDL206W 2289 nt0.1□□□□□ -2.39
SCC2Q04002 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.1□□□□□ -2.39
SCC2Q04002 PRM8YGL053W 714 nt0.1□□□□□ -2.39
SCC2Q04002 IRC14YOR135C 342 nt0.1□□□□□ -2.39
SCC2Q04002 MUB1YMR100W 1863 nt0.09□□□□□ -2.39
SCC2Q04002 YFR054CYFR054C 579 nt0.09□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 POP8YBL018C 402 nt0.09□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 YOL050CYOL050C 321 nt0.09□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 HDA3YPR179C 1968 nt0.08□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 YGL138CYGL138C 1038 nt0.07□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 YIR020CYIR020C 303 nt0.07□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 JJJ2YJL162C 1752 nt0.07□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 GDS1YOR355W 1569 nt0.06□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 FAR7YFR008W 666 nt0.06□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 YIL141WYIL141W 390 nt0.06□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 SDL1YIL167W 633 nt0.06□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 YHR022CYHR022C 771 nt0.05□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 YOR203WYOR203W 354 nt0.05□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt0.05□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 EMC5YIL027C 426 nt0.04□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 SRP21YKL122C 504 nt0.04□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt0.04□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 PXA2YKL188C 2562 nt0.04□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 NIP100YPL174C 2607 nt0.04□□□□□ -2.4
SCC2Q04002 YMR324CYMR324C 243 nt0.03□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 YNR068CYNR068C 819 nt0.03□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 NUT1YGL151W 3399 nt0.02□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 MXR1YER042W 555 nt0.01□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt0.01□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 YGL109WYGL109W 324 nt0.01□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 TAN1YGL232W 870 nt0.01□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 RPB5YBR154C 648 nt0.01□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 MSC6YOR354C 2079 nt0.01□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 SPT21YMR179W 2277 nt0□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 URB1YKL014C 5295 nt-0□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 ECM11YDR446W 909 nt-0.01□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 HAL9YOL089C 3093 nt-0.01□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 DAS1YJL149W 1992 nt-0.01□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 RPL37AYLR185W 267 nt-0.02□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 LOA1YPR139C 903 nt-0.02□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 MGR1YCL044C 1254 nt-0.02□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 AFR1YDR085C 1863 nt-0.02□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 PSO2YMR137C 1986 nt-0.02□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 RRG1YDR065W 1098 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 ALG5YPL227C 1005 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 AHC2YCR082W 387 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 CYC7YEL039C 342 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 ERV14YGL054C 417 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 BMT5YIL096C 1011 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 YOR053WYOR053W 342 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCC2Q04002 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.04□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 COBQ0105 1158 nt-0.04□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 RPL40BYKR094C 387 nt-0.04□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 YBL077WYBL077W 432 nt-0.04□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 YLR225CYLR225C 1224 nt-0.05□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 SWF1YDR126W 1011 nt-0.06□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 YGR114CYGR114C 390 nt-0.06□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 FYV4YHR059W 393 nt-0.06□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 YPL034WYPL034W 498 nt-0.06□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt-0.07□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt-0.07□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.07□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 DBP6YNR038W 1890 nt-0.07□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 SRB4YER022W 2064 nt-0.07□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 TCA17YEL048C 459 nt-0.08□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 RCN1YKL159C 636 nt-0.08□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 MAM1YER106W 909 nt-0.09□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 RPI1YIL119C 1224 nt-0.09□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt-0.09□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 SLX4YLR135W 2247 nt-0.09□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 NOP10YHR072W-A 177 nt-0.1□□□□□ -2.42
SCC2Q04002 NDD1YOR372C 1665 nt-0.1□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 COX3Q0275 810 nt-0.1□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 PFK27YOL136C 1194 nt-0.1□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt-0.11□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 VPS25YJR102C 609 nt-0.11□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 RMD5YDR255C 1266 nt-0.12□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 LAG1YHL003C 1236 nt-0.12□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 TIF11YMR260C 462 nt-0.12□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 CIN2YPL241C 807 nt-0.12□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 UPF3YGR072W 1164 nt-0.13□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 MKT1YNL085W 2493 nt-0.13□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 VIK1YPL253C 1944 nt-0.14□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 YJL007CYJL007C 315 nt-0.14□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 BFR1YOR198C 1413 nt-0.14□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 DSE1YER124C 1722 nt-0.14□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 PIG1YLR273C 1947 nt-0.14□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 YDL196WYDL196W 330 nt-0.15□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 VPS74YDR372C 1038 nt-0.15□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 YGR164WYGR164W 336 nt-0.15□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 TOF2YKR010C 2316 nt-0.15□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 PGA1YNL158W 597 nt-0.15□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 RSM28YDR494W 1086 nt-0.16□□□□□ -2.43
SCC2Q04002 HSK3YKL138C-A 210 nt-0.16□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.2 ms