Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ERCC6Q03468 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms