Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms