Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP1P78357 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP1P78357 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms