Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM193AP78312 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms