Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms