Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms